Perpustakaan MAN 2 Kudus bernama Perpustakaan Harun Al-Rasyid yang terletak di lantai 1 area barat. Perpustakaan madrasah sebagai salah satu sarana pendidikan penunjang kegiatan belajar siswa memegang peranan yang sangat penting dalam memacu tercapainya tujuan pendidikan di madrasah. Perpustakaan Harun Al-Rasyid menyediakan berbagai macam literasi dan referensi untuk menunjukkan pembelajaran dan riset.
Ruang Perpustakaan
Pelayanan Peminjaman dan Pengembalian Buku
Selain peminjaman dan pengembalian buku, perpustakaan Harun Al-Rasyid juga dijugakan sebagai tempat pembelajaran classical oleh beberapa guru.