Gedung laboratorium olimpiade sains terpadu diperuntukkan untuk mendukung pembelajaran praktikum siswa. Terdapat berbagai macam laboratorium di lantai 1-3 antara lain : laboratorium fisika terpadu, laboratorium kimia terpadu, laboratorium biologi, dan laboratorium geografi. Lantai 4 terdapat ruang pertemuan atau hall room yang dipergunakan untuk rapat, pertemuan orang tua/wali, dan focus group discussion. Lantai 5 terdapat ruang untuk kegiatan seperti melihat hilal.
Laboratorium sebagai tempat praktikum
Hall Room lantai 4 sebagai tempat pertemuan
Kegiatan melihat hilal di lantai 5